Thủ tục nhập khẩu thực phẩm chức năng luôn là mối quan tâm hàng đầu của các doanh nghiệp kinh doanh sản phẩm chăm sóc sức khỏe. Bài viết dưới đây sẽ giúp bạn nắm rõ toàn bộ quy trình cập nhật mới nhất năm 2025.
Thủ tục nhập khẩu thực phẩm chức năng đang ngày càng phức tạp hơn do yêu cầu kiểm soát chặt chẽ của Bộ Y tế. Các doanh nghiệp cần nắm rõ quy trình và pháp lý để tránh rủi ro.
1. Tổng quan về thực phẩm chức năng nhập khẩu tại Việt Nam
Thực phẩm chức năng được phân loại theo công dụng và thành phần. Nhóm sản phẩm này không chỉ chịu sự quản lý của hải quan mà còn phải tuân thủ nghiêm ngặt quy định từ Cục An toàn thực phẩm.
Hiện nay, nhu cầu sử dụng thực phẩm chức năng nhập khẩu tăng cao, kéo theo nhiều doanh nghiệp tham gia phân phối sản phẩm từ Mỹ, EU, Nhật Bản và Hàn Quốc.
Tuy nhiên, để thực hiện nhập khẩu hiệu quả, doanh nghiệp cần chuẩn bị kỹ hồ sơ và thủ tục pháp lý để không bị trì hoãn thông quan hoặc bị xử phạt.
2. Quy trình thủ tục nhập khẩu thực phẩm chức năng chi tiết theo 5 bước
Bước 1: Đăng ký công bố sản phẩm tại Cục An toàn thực phẩm
Thủ tục nhập khẩu thực phẩm chức năng bắt buộc phải có giấy phép công bố sản phẩm. Hồ sơ gồm giấy chứng nhận tự do lưu hành (Free Sale), thành phần sản phẩm, nhãn phụ tiếng Việt…
Doanh nghiệp cần chuẩn bị bản phân tích thành phần, COA (Certificate of Analysis) và nhãn gốc. Cơ quan cấp phép sẽ kiểm tra và xác nhận sản phẩm đủ điều kiện lưu hành tại Việt Nam.
Bước 2: Xin giấy phép kiểm tra nhà nước về an toàn thực phẩm
Với các lô hàng thực phẩm chức năng nhập khẩu lần đầu hoặc có thay đổi công thức, bắt buộc phải kiểm tra an toàn thực phẩm tại cơ quan chức năng.
Hồ sơ cần có công văn đề nghị kiểm tra, giấy công bố đã được cấp, invoice, packing list và hợp đồng nhập khẩu (sale contract).
Quy trình kiểm tra kéo dài từ 7–10 ngày tùy loại hàng và cơ quan kiểm tra. Việc không thực hiện bước này có thể dẫn tới phạt hành chính và giữ hàng tại cảng.

Bước 3: Chuẩn bị bộ chứng từ nhập khẩu
Thủ tục nhập khẩu thực phẩm chức năng sẽ không thể thực hiện nếu thiếu bộ chứng từ gồm:
- Hóa đơn thương mại (invoice)
- Phiếu đóng gói (packing list)
- Vận đơn (B/L hoặc AWB)
- Hợp đồng thương mại
- Giấy công bố sản phẩm
- Giấy kiểm tra ATTP
- Tờ khai hải quan điện tử
Chứng từ phải trùng khớp tuyệt đối về thông tin để tránh bị hải quan nghi ngờ và yêu cầu bổ sung, kiểm hóa.
Bước 4: Mở tờ khai và thông quan
Sau khi đủ hồ sơ, doanh nghiệp khai báo hải quan qua hệ thống VNACCS/VCIS. Tùy theo mức độ rủi ro của hàng hóa, hệ thống phân luồng xanh, vàng hoặc đỏ.
Nếu luồng xanh: thông quan ngay.
Luồng vàng: nộp hồ sơ giấy để cán bộ kiểm tra.
Luồng đỏ: kiểm tra thực tế hàng hóa và hồ sơ.
Việc khai báo chính xác mã HS, trị giá khai báo và các chỉ tiêu kỹ thuật là yếu tố then chốt để hàng được thông quan thuận lợi.
Bước 5: Giao hàng về kho và hậu kiểm
Sau khi hoàn tất thủ tục hải quan, hàng sẽ được vận chuyển về kho. Tuy nhiên, thực phẩm chức năng nhập khẩu vẫn có thể bị hậu kiểm từ cơ quan quản lý.
Doanh nghiệp nên lưu trữ đầy đủ hồ sơ và chứng từ trong ít nhất 3 năm để phục vụ thanh tra, kiểm tra bất ngờ.
3. Lưu ý đặc biệt khi thực hiện thủ tục nhập khẩu thực phẩm chức năng
Chọn đúng mã HS
Mỗi loại thực phẩm chức năng có mã HS khác nhau, quyết định thuế nhập khẩu và kiểm tra chuyên ngành. Sai mã HS có thể dẫn đến sai mức thuế hoặc phạt.
Mã HS thường dùng: 2106.90.72, 2106.90.98, nhưng phải tùy theo công dụng, thành phần cụ thể từng sản phẩm.
Hiểu rõ mức thuế nhập khẩu và thuế GTGT
Thuế nhập khẩu dao động từ 0–30% tùy nước xuất xứ và cam kết FTA. Thuế GTGT thông thường là 5% hoặc 10%.
Nếu nhập khẩu từ EU hoặc Hàn Quốc, có thể xin ưu đãi thuế nếu có CO form E, AK, hoặc EUR.1 kèm theo.
Chứng từ từ nhà cung cấp phải chính xác tuyệt đối
Nhiều lô hàng bị ách lại do sai lệch tên hàng, thành phần, đơn vị tính… giữa invoice và giấy công bố sản phẩm. Do đó, doanh nghiệp nên yêu cầu nhà cung cấp chuẩn hóa chứng từ ngay từ đầu.

Dán nhãn phụ đúng chuẩn trước khi đưa ra thị trường
Nhãn phụ tiếng Việt phải thể hiện đủ nội dung: tên sản phẩm, thành phần, nhà sản xuất, đơn vị nhập khẩu, hướng dẫn sử dụng, ngày sản xuất – hạn dùng…
Không ghi đủ thông tin hoặc sai nội dung nhãn có thể bị xử phạt đến 70 triệu đồng theo Nghị định 98/2020/NĐ-CP.
4. Dịch vụ khai báo hải quan toàn diện tại Lê Nguyễn Transport & Logistics
Tại Lê Nguyễn Transport & Logistics, chúng tôi cung cấp giải pháp khai báo hải quan trọn gói và dịch vụ phòng xuất nhập khẩu thuê ngoài chuyên nghiệp, giúp doanh nghiệp tiết kiệm thời gian, chi phí và nguồn lực nội bộ.
Dịch vụ khai báo hải quan chuyên sâu – xử lý trọn gói
Với hơn 10 năm kinh nghiệm trong lĩnh vực logistics và thông quan, chúng tôi hỗ trợ khách hàng khai báo hải quan cho mọi loại hình hàng hóa:
- Khai báo hải quan cho hàng đường biển, đường hàng không, chuyển phát nhanh, hàng tại chỗ, gia công, sản xuất xuất khẩu, tạm nhập tái xuất.
- Xử lý hồ sơ hàng hóa đặc thù như hàng nguy hiểm, hàng gửi kho ngoại quan, hàng phải kiểm tra chuyên ngành.
- Tư vấn và xin cấp C/O (Certificate of Origin) cho đầy đủ các Form như A, B, AI, AK, CPTPP, REX, ISP… đúng yêu cầu thị trường xuất khẩu.
- Thực hiện toàn bộ thủ tục kiểm tra chuyên ngành: kiểm hóa, kiểm dịch thực vật – động vật, kiểm tra chất lượng, chứng nhận hợp quy, giám định kỹ thuật.
Tất cả quy trình được thực hiện đồng bộ bởi đội ngũ chuyên viên giàu kinh nghiệm, đảm bảo không phát sinh chi phí ngoài thỏa thuận, minh bạch trong báo giá và tối ưu thời gian thông quan.
Phòng xuất nhập khẩu thuê ngoài – giải pháp tối ưu cho doanh nghiệp
Đối với các doanh nghiệp vừa và nhỏ chưa có bộ phận xuất nhập khẩu chuyên trách, hoặc doanh nghiệp lớn cần tối ưu hóa vận hành, Lê Nguyễn cung cấp dịch vụ phòng xuất nhập khẩu thuê ngoài với quy trình chuyên nghiệp, linh hoạt:
- Đại diện doanh nghiệp làm việc với các cơ quan hải quan, bộ ngành, cảng vụ, hãng tàu, hãng bay.
- Chuẩn bị, kiểm tra, hoàn thiện bộ chứng từ xuất nhập khẩu, hợp đồng, invoice, packing list, vận đơn, C/O và các loại giấy phép liên quan.
- Theo dõi tiến độ vận chuyển, hỗ trợ giải quyết các vấn đề phát sinh trong quá trình thông quan hoặc vận hành logistics.
- Đảm nhận vai trò phòng xuất nhập khẩu từ xa, nhưng đảm bảo hiệu quả như một bộ phận nội bộ.
Giải pháp thuê ngoài phòng XNK giúp doanh nghiệp tập trung vào hoạt động sản xuất – kinh doanh cốt lõi, đồng thời vẫn đảm bảo hiệu quả vận hành chuỗi cung ứng và tuân thủ đúng quy định pháp lý.
Vì sao doanh nghiệp chọn Lê Nguyễn Transport & Logistics?
- Mỗi khách hàng có một chuyên viên phụ trách riêng, theo dõi và xử lý xuyên suốt từ đầu đến cuối.
- Dịch vụ trọn gói không chia nhỏ, không đùn đẩy trách nhiệm giữa các bộ phận.
- Mạng lưới đối tác quốc tế tại Trung Quốc, Singapore, Malaysia, Ấn Độ, Úc hỗ trợ mở rộng luồng hàng và tối ưu chi phí logistics.
- Cam kết minh bạch, không phát sinh chi phí ngoài báo giá.
Chúng tôi không chỉ thực hiện dịch vụ logistics.
Chúng tôi đồng hành như một bộ phận xuất nhập khẩu chuyên nghiệp bên trong doanh nghiệp bạn.
>> Xem thêm:
Các hình thức xuất khẩu phổ biến và ví dụ thực tế giúp doanh nghiệp tăng trưởng bền vững năm 2025
Thủ tục khai báo hải quan mặt hàng điện tử: 5 bước cần biết để thông quan nhanh chóng
5 điều cần biết về Issued Retroactively trong C/O – Giảm rủi ro thủ tục hải quan khi xuất khẩu
Liên hệ ngay để được tư vấn
📍 Địa chỉ: 131/6, Đường số 8, Linh Xuân, Thủ Đức, Tp HCM
🌐 Website: lenguyentst.com.vn
📞 Hotline/Zalo: 0961296889
📧 Email: marketing@lenguyentst.com.vn
Dịch vụ Khai báo Hải Quan tại Lê Nguyễn Transport & Logistics
Lê Nguyễn Transport & Logistics cam kết mang đến dịch vụ khai báo hải quan chuyên nghiệp cho tất cả các loại hình vận tải, bao gồm đường hàng không, đường biển và đường bộ. Chúng tôi giúp doanh nghiệp tối ưu chi phí, rút ngắn thời gian thông quan và đảm bảo hàng hóa được xử lý nhanh chóng, an toàn.
Với đội ngũ chuyên viên giàu kinh nghiệm, am hiểu sâu sắc về quy định hải quan và xuất nhập khẩu, chúng tôi không chỉ hỗ trợ khai báo chính xác mà còn tư vấn tận tình, giúp khách hàng hạn chế rủi ro, tránh phát sinh chi phí không mong muốn. Chúng tôi luôn đồng hành cùng doanh nghiệp trong từng bước của quy trình xuất nhập khẩu, đảm bảo hàng hóa được thông quan thuận lợi nhất và mang lại giá trị tối ưu cho khách hàng.

