Cách tra cứu nợ thuế hải quan cho doanh nghiệp cuối năm 2025

Tra cứu nợ thuế hải quan là là mối quan tâm lớn của hầu hết doanh nghiệp khi bước vào giai đoạn chốt số liệu cuối năm 2025. Ở thời điểm này, doanh nghiệp cần một cách tiếp cận đủ sâu, đủ chính xác để đọc đúng dữ liệu trên hệ thống Hải quan Việt Nam, nhận diện đúng khoản thuế nhập khẩu và thuế giá trị gia tăng đang treo, từ đó xử lý dứt điểm trước khi bước sang kỳ tài chính mới.

Trong bài viết này, Lê Nguyễn Transport and Logistics sẽ hướng dẫn cách tra cứu nợ thuế hải quan và xác định xem doanh nghiệp của mình có đang nợ thuế hay không.

1. Bản chất của việc tra cứu nợ thuế hải quan: xác nhận trạng thái dữ liệu, không đối chiếu dòng tiền

Về bản chất, tra cứu nợ thuế hải quan không nhằm kiểm tra doanh nghiệp đã chuyển tiền hay chưa, mà nhằm xác nhận trạng thái nghĩa vụ thuế đã được hệ thống hải quan ghi nhận hay chưa.

Trên hệ thống quản lý của Hải quan Việt Nam, một khoản thuế chỉ được xem là hoàn tất khi đồng thời đáp ứng:

Khoản nộp được hạch toán thành công;
Gắn đúng số tờ khai phát sinh nghĩa vụ;
Xác định đúng sắc thuế (thuế nhập khẩu hoặc thuế giá trị gia tăng).

Vì vậy, không ít trường hợp doanh nghiệp đã nộp tiền nhưng kết quả tra cứu nợ thuế hải quan vẫn hiển thị nợ. Nguyên nhân nằm ở dữ liệu chưa được tất toán đúng, chứ không xuất phát từ việc chưa thực hiện nghĩa vụ tài chính.

2. Đọc kết quả tra cứu nợ thuế hải quan theo từng sắc thuế, không đọc gộp

Một sai lệch phổ biến khi tra cứu nợ thuế hải quan là nhìn vào tổng số tiền mà bỏ qua cấu trúc từng sắc thuế. Trong thực tiễn, mỗi loại thuế có cơ chế phát sinh và tất toán khác nhau, cần được đọc tách biệt.

2.1. Thuế nhập khẩu

Thuế nhập khẩu thường bị treo trong các tình huống:

Tờ khai thông quan bằng bảo lãnh nhưng chưa tất toán;
Mã HS bị điều chỉnh sau thông quan làm thay đổi thuế suất;
Hồ sơ C/O nộp bổ sung nhưng chưa được chấp nhận trên hệ thống.

Khi kết quả tra cứu nợ thuế hải quan vẫn hiển thị thuế nhập khẩu, điều đó đồng nghĩa tờ khai liên quan chưa hoàn thành nghĩa vụ, dù hàng hóa đã thông quan từ trước.

2.2. Thuế giá trị gia tăng

Thuế giá trị gia tăng đối với hàng nhập khẩu là khoản dễ bị bỏ sót nhất khi rà soát cuối năm:

Nộp VAT nhưng sai thông tin tờ khai;
Nộp gộp nhiều tờ khai khiến dữ liệu hạch toán không khớp;
Chỉ tập trung xử lý thuế nhập khẩu mà chưa rà soát VAT.

Do đó, khi tra cứu nợ thuế hải quan, cần xác định rõ nợ đang nằm ở thuế nhập khẩu hay thuế giá trị gia tăng, thay vì chỉ nhìn vào con số tổng hợp.

Đọc kết quả tra cứu nợ thuế hải quan theo từng sắc thuế, không đọc gộp

3. Cách tra cứu nợ thuế hải quan đúng và đủ sâu để ra kết luận

Đây là nội dung then chốt quyết định việc tra cứu nợ thuế hải quan có thực sự mang lại giá trị hay không.

3.1. Tra cứu theo mã số thuế – bước rà soát tổng thể bắt buộc

Tra cứu theo mã số thuế là bước nền tảng khi doanh nghiệp kiểm tra nghĩa vụ thuế cuối năm.

Mục tiêu của bước này:

Xác nhận doanh nghiệp còn hay không còn nợ thuế hải quan;
Nhận diện sắc thuế đang treo (thuế nhập khẩu, thuế giá trị gia tăng);
Đánh giá nguy cơ ảnh hưởng đến việc mở tờ khai kỳ tiếp theo.

Cách đọc kết quả:

Không hiển thị nợ: nghĩa vụ thuế hải quan đã được tất toán tại thời điểm tra cứu;
Có hiển thị nợ: cần ghi nhận rõ tên sắc thuế, thời điểm phát sinh và trạng thái trong hạn/quá hạn.

Tra cứu theo mã số thuế cho bức tranh tổng thể, nhưng chưa đủ để xử lý chi tiết.

3.2. Tra cứu theo tờ khai – bước khoanh vùng và xử lý nguyên nhân

Sau khi xác định còn nợ qua mã số thuế, doanh nghiệp cần tiếp tục tra cứu nợ thuế hải quan theo từng tờ khai.

Bước này nhằm trả lời ba câu hỏi trọng tâm:

Khoản nợ phát sinh từ tờ khai nào;
Thuộc thuế nhập khẩu hay thuế giá trị gia tăng;
Phát sinh từ nghĩa vụ ban đầu hay từ điều chỉnh sau thông quan.

Tra cứu theo tờ khai giúp khoanh vùng chính xác nguyên nhân, là cơ sở để đối chiếu chứng từ nộp thuế và tránh nộp sai hoặc nộp trùng.

3.3. Thứ tự tra cứu cần tuân thủ trong thực tế

Trong vận hành thực tế, thứ tự tra cứu nợ thuế hải quan cần được thực hiện theo logic:

Tra cứu theo mã số thuế để xác định còn nợ hay không;
Tra cứu theo từng tờ khai để xác định nguồn gốc khoản nợ;
Đối chiếu với chứng từ nộp thuế để chuẩn bị phương án xử lý.

Việc bỏ qua hoặc đảo ngược thứ tự này thường khiến doanh nghiệp tra cứu nhiều lần nhưng không ra được kết luận cuối cùng.

4. Xử lý nợ thuế hải quan cuối năm: yêu cầu dứt điểm và kịp thời

Sau khi tra cứu nợ thuế hải quan, doanh nghiệp cần xử lý ngay các khoản còn tồn, kể cả những khoản có giá trị nhỏ.

Thực tế cho thấy, nợ thuế treo sang năm sau có thể dẫn đến:

Không mở được tờ khai đầu năm;
Phát sinh tiền chậm nộp không cần thiết;
Ảnh hưởng mức độ tuân thủ trong đánh giá rủi ro.

Vì vậy, xử lý đúng sau tra cứu cần bao gồm:

Xác định chính xác sắc thuế đang treo;
Đối chiếu dữ liệu hải quan với chứng từ nộp thuế;
Tất toán dứt điểm trên hệ thống trước khi kết thúc năm tài chính.

Tra cứu nợ thuế hải quan được thực hiện đúng phương pháp và đọc đúng bản chất dữ liệu. Việc rà soát theo trình tự hợp lý, phân tích rõ thuế nhập khẩu và thuế giá trị gia tăng, đồng thời xử lý dứt điểm các khoản còn tồn, giúp doanh nghiệp kiểm soát hiệu quả nghĩa vụ thuế với Hải quan Việt Nam và đảm bảo hoạt động xuất nhập khẩu diễn ra thông suốt khi bước sang năm 2026.

Xử lý nợ thuế hải quan cuối năm: yêu cầu dứt điểm và kịp thời

5. Dịch vụ khai báo hải quan toàn diện tại Lê Nguyễn Transport & Logistics

Tại Lê Nguyễn Transport & Logistics, chúng tôi cung cấp giải pháp khai báo hải quan trọn gói và dịch vụ phòng xuất nhập khẩu thuê ngoài chuyên nghiệp, giúp doanh nghiệp tiết kiệm thời gian, chi phí và nguồn lực nội bộ.

Dịch vụ khai báo hải quan chuyên sâu – xử lý trọn gói

Với hơn 10 năm kinh nghiệm trong lĩnh vực logistics và thông quan, chúng tôi hỗ trợ khách hàng khai báo hải quan cho mọi loại hình hàng hóa:

Khai báo hải quan cho hàng đường biển, đường hàng không, chuyển phát nhanh, hàng tại chỗ, gia công, sản xuất xuất khẩu, tạm nhập tái xuất.
Xử lý hồ sơ hàng hóa đặc thù như hàng nguy hiểm, hàng gửi kho ngoại quan, hàng phải kiểm tra chuyên ngành.
Tư vấn và xin cấp C/O (Certificate of Origin) cho đầy đủ các Form như A, B, AI, AK, CPTPP, REX, ISP… đúng yêu cầu thị trường xuất khẩu.
Thực hiện toàn bộ thủ tục kiểm tra chuyên ngành: kiểm hóa, kiểm dịch thực vật – động vật, kiểm tra chất lượng, chứng nhận hợp quy, giám định kỹ thuật.

Tất cả quy trình được thực hiện đồng bộ bởi đội ngũ chuyên viên giàu kinh nghiệm, đảm bảo không phát sinh chi phí ngoài thỏa thuận, minh bạch trong báo giá và tối ưu thời gian thông quan.

Phòng xuất nhập khẩu thuê ngoài – giải pháp tối ưu cho doanh nghiệp

Đối với các doanh nghiệp vừa và nhỏ chưa có bộ phận xuất nhập khẩu chuyên trách, hoặc doanh nghiệp lớn cần tối ưu hóa vận hành, Lê Nguyễn cung cấp dịch vụ phòng xuất nhập khẩu thuê ngoài với quy trình chuyên nghiệp, linh hoạt:

Đại diện doanh nghiệp làm việc với các cơ quan hải quan, bộ ngành, cảng vụ, hãng tàu, hãng bay.
Chuẩn bị, kiểm tra, hoàn thiện bộ chứng từ xuất nhập khẩu, hợp đồng, invoice, packing list, vận đơn, C/O và các loại giấy phép liên quan.
Theo dõi tiến độ vận chuyển, hỗ trợ giải quyết các vấn đề phát sinh trong quá trình thông quan hoặc vận hành logistics.
Đảm nhận vai trò phòng xuất nhập khẩu từ xa, nhưng đảm bảo hiệu quả như một bộ phận nội bộ.

Giải pháp thuê ngoài phòng XNK giúp doanh nghiệp tập trung vào hoạt động sản xuất – kinh doanh cốt lõi, đồng thời vẫn đảm bảo hiệu quả vận hành chuỗi cung ứng và tuân thủ đúng quy định pháp lý.

Vì sao doanh nghiệp chọn Lê Nguyễn Transport & Logistics?

Mỗi khách hàng có một chuyên viên phụ trách riêng, theo dõi và xử lý xuyên suốt từ đầu đến cuối.
Dịch vụ trọn gói không chia nhỏ, không đùn đẩy trách nhiệm giữa các bộ phận.
Mạng lưới đối tác quốc tế tại Trung Quốc, Singapore, Malaysia, Ấn Độ, Úc hỗ trợ mở rộng luồng hàng và tối ưu chi phí logistics.
Cam kết minh bạch, không phát sinh chi phí ngoài báo giá.

Chúng tôi không chỉ thực hiện dịch vụ logistics.
Chúng tôi đồng hành như một bộ phận xuất nhập khẩu chuyên nghiệp bên trong doanh nghiệp bạn.

>> Xem thêm:

Liên hệ ngay để được tư vấn

📍 Địa chỉ: 131/6, Đường số 8, Linh Xuân, Thủ Đức, Tp HCM
🌐 Website: khaibaohaiquanvn.com/
📞 Hotline/Zalo: 0902 916 031
📧 Email: khaibaohaiquan@lenguyentst.com.vn

Dịch vụ Khai báo Hải Quan tại Lê Nguyễn Transport & Logistics

Lê Nguyễn Transport & Logistics cam kết mang đến dịch vụ khai báo hải quan chuyên nghiệp cho tất cả các loại hình vận tải, bao gồm đường hàng không, đường biển và đường bộ. Chúng tôi giúp doanh nghiệp tối ưu chi phí, rút ngắn thời gian thông quan và đảm bảo hàng hóa được xử lý nhanh chóng, an toàn.

Với đội ngũ chuyên viên giàu kinh nghiệm, am hiểu sâu sắc về quy định hải quan và xuất nhập khẩu, chúng tôi không chỉ hỗ trợ khai báo chính xác mà còn tư vấn tận tình, giúp khách hàng hạn chế rủi ro, tránh phát sinh chi phí không mong muốn. Chúng tôi luôn đồng hành cùng doanh nghiệp trong từng bước của quy trình xuất nhập khẩu, đảm bảo hàng hóa được thông quan thuận lợi nhất và mang lại giá trị tối ưu cho khách hàng.

Bản tin thị trường, Pháp lý