Trong hoạt động gia công và sản xuất xuất khẩu, kho hàng không chỉ là nơi lưu trữ mà còn là “trái tim” của các đợt quyết toán thuế. Tuy nhiên, thực tế kiểm tra sau thông quan năm 2026 cho thấy nhiều doanh nghiệp vẫn vấp phải những lỗi sơ đẳng nhưng gây hậu quả pháp lý cực kỳ nghiêm trọng.
Dựa trên thực trạng ngành, Lê Nguyễn Transport & Logistics đã tổng hợp 3 sai lầm phổ biến khi quản lý kho gia công khiến hồ sơ của bạn rơi vào diện rủi ro cao. Hãy cùng phân tích chi tiết để tránh việc bị truy thu thuế ngoài ý muốn.
1. Sai lầm khi sử dụng sai nguồn nguyên liệu giữa các loại hình
Đây là lỗi phổ biến nhất liên quan đến việc nhầm lẫn mục đích sử dụng nguyên vật liệu đầu vào. Trong bối cảnh quản lý chặt chẽ của năm 2026, cơ quan hải quan đặc biệt chú trọng đến tính đúng đắn của nguồn vốn hàng hóa.
Nội dung sai lầm: Doanh nghiệp thực hiện lấy nguyên liệu của loại hình sản xuất xuất khẩu (loại hình vốn được miễn thuế) để đưa vào sản xuất cho các đơn hàng bán nội địa (loại hình phải đóng thuế) mà không làm thủ tục chuyển đổi mục đích sử dụng.
Hệ lụy pháp lý:
-
Vi phạm quản lý thuế: Hành vi này bị coi là hành vi trốn thuế hoặc gian lận thuế vì doanh nghiệp đang dùng hàng miễn thuế để kinh doanh sinh lời trong nước.
-
Căn cứ pháp lý: Theo Thông tư 39/2018/TT-BTC, mọi thay đổi mục đích sử dụng từ miễn thuế sang đóng thuế phải được khai báo bằng tờ khai thay đổi mục đích sử dụng trước khi đưa vào sản xuất nội địa. Nếu bị phát hiện khi kiểm tra sau thông quan, doanh nghiệp sẽ bị truy thu thuế nhập khẩu, thuế GTGT và tiền chậm nộp.

2. Thiếu sự tách biệt kho giữa nguyên liệu nhập khẩu và mua nội địa
Một sai lầm nghiêm trọng khác trong quản lý kho gia công là việc duy trì thói quen để hàng hóa lẫn lộn, gây khó khăn cho công tác đối soát dữ liệu.
Nội dung sai lầm: Doanh nghiệp không thực hiện tách biệt kho, để lẫn lộn giữa nguyên liệu nhập khẩu (hàng miễn thuế) và nguyên liệu mua trong nước. Điều này dẫn đến tình trạng khi cơ quan thuế hoặc hải quan tiến hành kiểm kê thực tế, doanh nghiệp không thể chứng minh được số lượng tồn kho riêng biệt của hàng miễn thuế.
Rủi ro đối với doanh nghiệp:
-
Mất khả năng giải trình: Khi không phân định được đâu là hàng mua trong nước (đã đóng thuế) và đâu là hàng gia công (miễn thuế), hải quan có quyền ấn định rằng toàn bộ hàng thiếu hụt là hàng miễn thuế đã bị tẩu tán.
-
Ảnh hưởng báo cáo quyết toán: Sự lẫn lộn này khiến hàng tồn kho trên sổ sách và thực tế không bao giờ khớp nhau, trực tiếp dẫn đến việc bác bỏ báo cáo quyết toán năm 2026.

3. Duy trì tình trạng hàng tồn kho ảo trên sổ sách
Sai lầm thứ ba đánh trực tiếp vào tính trung thực của hồ sơ doanh nghiệp, đó là sự chênh lệch giữa dữ liệu kế toán và hiện trạng tại bãi.
Nội dung sai lầm: Tình trạng hàng tồn kho ảo xảy ra khi trên sổ sách kế toán vẫn còn tồn nhưng thực tế dưới kho hàng đã mất mát, hư hỏng hoặc nghiêm trọng nhất là đã xuất bán mà chưa làm tờ khai hải quan.
Hậu quả từ cơ quan chức năng:
-
Nghi vấn tẩu tán hàng hóa: Việc hàng đã xuất đi nhưng không có tờ khai tương ứng bị khép vào tội buôn lậu hoặc vận chuyển trái phép hàng hóa qua biên giới nếu không có lý do chính đáng.
-
Loại bỏ chi phí hợp lý: Các khoản hàng mất mát, hư hỏng nếu không có biên bản giám định và xử lý theo quy định hải quan sẽ không được chấp nhận là chi phí hợp lý khi quyết toán thuế.
-
Truy thu 100%: Năm 2026, với hệ thống đối soát tự động, bất kỳ mã hàng nào còn “tồn ảo” quá thời hạn sản xuất thông thường sẽ bị cơ quan hải quan đưa vào diện kiểm tra trọng điểm tại trụ sở doanh nghiệp.

4. Giải pháp tối ưu quản lý kho từ Lê Nguyễn Transport & Logistics
Để khắc phục 3 sai lầm phổ biến khi quản lý kho gia công nêu trên, doanh nghiệp cần thực hiện các bước kiện toàn hệ thống quản trị:
-
Thiết lập phần mềm quản lý kho thông minh: Đảm bảo tách biệt mã nguyên liệu theo loại hình (SXXK, Gia công, Kinh doanh).
-
Kiểm kê định kỳ: Thực hiện kiểm kê thực tế hàng tháng để xử lý ngay các tình trạng hư hỏng hoặc mất mát, tránh để tồn đọng đến kỳ quyết toán.
-
Hợp tác cùng đơn vị Logistics uy tín: Lê Nguyễn Transport & Logistics hỗ trợ khách hàng rà soát tính hợp lệ của tờ khai và đối chiếu định mức thực tế, giúp doanh nghiệp phát hiện sớm các rủi ro về nguồn nguyên liệu trước khi cơ quan thuế vào cuộc.
Quản lý kho hàng gia công yêu cầu sự chính xác tuyệt đối và tuân thủ chặt chẽ các quy định pháp luật hiện hành. Việc tránh được 3 sai lầm: dùng sai nguồn, không tách kho và tồn kho ảo sẽ là nền tảng giúp doanh nghiệp bảo vệ dòng tiền và uy tín trong hoạt động thương mại quốc tế năm 2026.
5. Dịch vụ khai báo hải quan toàn diện tại Lê Nguyễn Transport & Logistics
Tại Lê Nguyễn Transport & Logistics, chúng tôi cung cấp giải pháp khai báo hải quan trọn gói và dịch vụ phòng xuất nhập khẩu thuê ngoài chuyên nghiệp, giúp doanh nghiệp tiết kiệm thời gian, chi phí và nguồn lực nội bộ.
Dịch vụ khai báo hải quan chuyên sâu – xử lý trọn gói
Với hơn 10 năm kinh nghiệm trong lĩnh vực logistics và thông quan, chúng tôi hỗ trợ khách hàng khai báo hải quan cho mọi loại hình hàng hóa:
- Khai báo hải quan cho hàng đường biển, đường hàng không, chuyển phát nhanh, hàng tại chỗ, gia công, sản xuất xuất khẩu, tạm nhập tái xuất.
- Xử lý hồ sơ hàng hóa đặc thù như hàng nguy hiểm, hàng gửi kho ngoại quan, hàng phải kiểm tra chuyên ngành.
- Tư vấn và xin cấp C/O (Certificate of Origin) cho đầy đủ các Form như A, B, AI, AK, CPTPP, REX, ISP… đúng yêu cầu thị trường xuất khẩu.
- Thực hiện toàn bộ thủ tục kiểm tra chuyên ngành: kiểm hóa, kiểm dịch thực vật – động vật, kiểm tra chất lượng, chứng nhận hợp quy, giám định kỹ thuật.
Tất cả quy trình được thực hiện đồng bộ bởi đội ngũ chuyên viên giàu kinh nghiệm, đảm bảo không phát sinh chi phí ngoài thỏa thuận, minh bạch trong báo giá và tối ưu thời gian thông quan.
Phòng xuất nhập khẩu thuê ngoài – giải pháp tối ưu cho doanh nghiệp
Đối với các doanh nghiệp vừa và nhỏ chưa có bộ phận xuất nhập khẩu chuyên trách, hoặc doanh nghiệp lớn cần tối ưu hóa vận hành, Lê Nguyễn cung cấp dịch vụ phòng xuất nhập khẩu thuê ngoài với quy trình chuyên nghiệp, linh hoạt:
- Đại diện doanh nghiệp làm việc với các cơ quan hải quan, bộ ngành, cảng vụ, hãng tàu, hãng bay.
- Chuẩn bị, kiểm tra, hoàn thiện bộ chứng từ xuất nhập khẩu, hợp đồng, invoice, packing list, vận đơn, C/O và các loại giấy phép liên quan.
- Theo dõi tiến độ vận chuyển, hỗ trợ giải quyết các vấn đề phát sinh trong quá trình thông quan hoặc vận hành logistics.
- Đảm nhận vai trò phòng xuất nhập khẩu từ xa, nhưng đảm bảo hiệu quả như một bộ phận nội bộ.
Giải pháp thuê ngoài phòng XNK giúp doanh nghiệp tập trung vào hoạt động sản xuất – kinh doanh cốt lõi, đồng thời vẫn đảm bảo hiệu quả vận hành chuỗi cung ứng và tuân thủ đúng quy định pháp lý.
Vì sao doanh nghiệp chọn Lê Nguyễn Transport & Logistics?
- Mỗi khách hàng có một chuyên viên phụ trách riêng, theo dõi và xử lý xuyên suốt từ đầu đến cuối.
- Dịch vụ trọn gói không chia nhỏ, không đùn đẩy trách nhiệm giữa các bộ phận.
- Mạng lưới đối tác quốc tế tại Trung Quốc, Singapore, Malaysia, Ấn Độ, Úc hỗ trợ mở rộng luồng hàng và tối ưu chi phí logistics.
- Cam kết minh bạch, không phát sinh chi phí ngoài báo giá.
Chúng tôi không chỉ thực hiện dịch vụ logistics.
Chúng tôi đồng hành như một bộ phận xuất nhập khẩu chuyên nghiệp bên trong doanh nghiệp bạn.
>> Xem thêm:
- 4 Bước Quyết Toán Khi Chuyển Từ Gia Công Sang Sản Xuất Xuất Khẩu
- 5 Lưu Ý Khi Hải Quan Kiểm Tra Doanh Nghiệp Gia Công Đột Xuất
- 6 Bước Kiểm Toán Nội Bộ Trước Kỳ Quyết Toán Gia Công Hiệu Quả
Liên hệ ngay để được tư vấn
📍 Địa chỉ: 131/6, Đường số 8, Linh Xuân, Thủ Đức, Tp HCM
🌐 Website: khaibaohaiquanvn.com/
📞 Hotline/Zalo: 0902 916 031
📧 Email: khaibaohaiquan@lenguyentst.com.vn
Dịch vụ Khai báo Hải Quan tại Lê Nguyễn Transport & Logistics
Lê Nguyễn Transport & Logistics cam kết mang đến dịch vụ khai báo hải quan chuyên nghiệp cho tất cả các loại hình vận tải, bao gồm đường hàng không, đường biển và đường bộ. Chúng tôi giúp doanh nghiệp tối ưu chi phí, rút ngắn thời gian thông quan và đảm bảo hàng hóa được xử lý nhanh chóng, an toàn.
Với đội ngũ chuyên viên giàu kinh nghiệm, am hiểu sâu sắc về quy định hải quan và xuất nhập khẩu, chúng tôi không chỉ hỗ trợ khai báo chính xác mà còn tư vấn tận tình, giúp khách hàng hạn chế rủi ro, tránh phát sinh chi phí không mong muốn. Chúng tôi luôn đồng hành cùng doanh nghiệp trong từng bước của quy trình xuất nhập khẩu, đảm bảo hàng hóa được thông quan thuận lợi nhất và mang lại giá trị tối ưu cho khách hàng.

